Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM31Q9BZY9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms