Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms