Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms