Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGIP1Q9BQI5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms