Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPOCK3Q9BQ16 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms