Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RETNLBQ9BQ08 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms