Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms