Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms