Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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GTF3C6Q969F1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF3C6Q969F1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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