Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN4Q92575 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms