Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL2Q8NHH9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms