Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA6DQ8NFY4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms