Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC117Q8IWD4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms