Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms