Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms