Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms