Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C16orf54Q6UWD8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms