Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD2Q6PL18 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD2Q6PL18 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms