Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q6P435 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q6P435 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q6P435 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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