Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCDC144NLQ6NUI1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC144NLQ6NUI1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC144NLQ6NUI1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCDC144NLQ6NUI1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms