Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q5VSD8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms