Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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