Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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