Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms