Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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GEN1Q17RS7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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GEN1Q17RS7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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GEN1Q17RS7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GEN1Q17RS7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GEN1Q17RS7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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GEN1Q17RS7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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