Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms