Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms