Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRY1Q16526 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms