Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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