Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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