Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF11Q15544 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms