Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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