Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDCD1Q15116 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDCD1Q15116 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDCD1Q15116 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PDCD1Q15116 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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