Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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