Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAM2Q15035 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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TRAM2Q15035 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TRAM2Q15035 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TRAM2Q15035 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TRAM2Q15035 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TRAM2Q15035 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TRAM2Q15035 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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