Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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LAPTM4AQ15012 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAPTM4AQ15012 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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