Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FRMPD4Q14CM0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms