Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NWD1Q149M9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NWD1Q149M9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms