Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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COL19A1Q14993 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COL19A1Q14993 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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COL19A1Q14993 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL19A1Q14993 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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