Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
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SHROOM2Q13796 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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