Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CUL3Q13618 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CUL3Q13618 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL3Q13618 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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