Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF5Q13568 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF5Q13568 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms