Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2Q13563 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms