Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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ITGB3BPQ13352 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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