Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.768e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ACP1-202ENST00000272067 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.198e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.576e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.321e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EPHB6-205ENST00000486511 2300 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.732e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EPHB6-207ENST00000611578 3224 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EPHB6-209ENST00000616380 4409 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.434e-18■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EPHB6-208ENST00000614832 3861 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 AC022384.1-201ENST00000437082 2270 ntAPPRIS P5 TSL 212.32□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-6■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.96e-11■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.026e-11■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SREBF1-213ENST00000485080 1230 ntTSL 521.16■□□□□ 0.984e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SREBF1-218ENST00000578469 588 ntTSL 318.93■□□□□ 0.624e-7■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 NDUFB9-207ENST00000524241 654 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-21■■□□□ 13
PABPC4Q13310 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.273e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.073e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 UBE2A-208ENST00000628734 600 ntTSL 24.7□□□□□ -1.661e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.481e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MDK-207ENST00000441869 540 ntTSL 326.85■■□□□ 1.897e-12■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SEPT5-203ENST00000406172 1996 ntTSL 527.8■■■□□ 2.044e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.534e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.314e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.454e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.242e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.28e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 UBQLN1-206ENST00000533705 6055 ntTSL 1 (best)7.15□□□□□ -1.268e-10■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 PIH1D1-224ENST00000602226 341 ntTSL 320.74■□□□□ 0.913e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PIH1D1-208ENST00000595633 424 ntTSL 218.37■□□□□ 0.533e-8■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.623e-7■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 MMP24-AS1-204ENST00000438751 670 ntTSL 321.17■□□□□ 0.983e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.983e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MMP24-AS1-208ENST00000456350 634 ntTSL 420.66■□□□□ 0.93e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MMP24-AS1-202ENST00000433764 569 ntTSL 420.63■□□□□ 0.893e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MMP24-AS1-206ENST00000454184 547 ntTSL 420.4■□□□□ 0.863e-8■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 MMP24-AS1-210ENST00000566203 915 ntTSL 419.12■□□□□ 0.653e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MMP24-AS1-203ENST00000435366 1499 ntTSL 218.41■□□□□ 0.543e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MMP24-AS1-212ENST00000635104 1227 ntTSL 515.04■□□□□ -03e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 TXN2-205ENST00000487725 736 ntTSL 323.03■■□□□ 1.286e-7■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.066e-16■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 ATP5H-204ENST00000580649 2191 ntTSL 210.15□□□□□ -0.784e-12■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ATP13A2-206ENST00000502418 1201 ntTSL 321.6■■□□□ 1.052e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ATP13A2-205ENST00000466561 1851 ntTSL 521.47■■□□□ 1.032e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.145e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SARNP-202ENST00000546604 1163 ntTSL 213.32□□□□□ -0.285e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SARNP-205ENST00000552884 997 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.975e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.015e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 SARNP-206ENST00000552946 518 ntTSL 26.79□□□□□ -1.325e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 UBXN1-216ENST00000533908 739 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.132e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.844e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 AC024592.3-203ENST00000585661 431 ntAPPRIS P1 TSL 220.29■□□□□ 0.844e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.764e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NDUFA11-206ENST00000593233 657 ntTSL 319.58■□□□□ 0.724e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 AC024592.3-201ENST00000592091 2118 ntTSL 219.28■□□□□ 0.684e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.584e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.521e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EMC4-206ENST00000558205 1006 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.324e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EMC4-212ENST00000561246 2019 ntTSL 29.59□□□□□ -0.871e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EMC4-211ENST00000560947 709 ntTSL 36.97□□□□□ -1.291e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 HSPG2-210ENST00000481644 839 ntTSL 222.48■■□□□ 1.192e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 217.94■□□□□ 0.463e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.818e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.571e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.091e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.651e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.51e-7■■□□□ 13
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