Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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