Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PTP4A2Q12974 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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