Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBBP4Q09028 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms