Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms