Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms